PROJEKT “SKUPNOSTNA ZNANOST IN BOJ PROTI KORONA VIRUSU”

Zaščita zoper Covid-19

Projekt “SKUPNOSTNA ZNANOST IN BOJ PROTI KORONA VIRUSU” je odprt projekt skupnosti dobromislečih raziskovalcev in prostovoljcev s podporo CTK in drugih organizacij, ki želijo s svojim delom, znanjem in izkušnjami, prispevati kamenček v mozaiku poznavanja novega korona virusa in bolezni COVID-19, ki jo ta virus povzroča. Skupino vodi dr. Črtomir Podlipnik in dr. Marko Jukić, z dolgoletnimi izkušnjami s področja računalniško podprtega načrtovanja molekul, farmacevtske kemije in kemo/bioinformatike.

S somišljeniki ter prostovoljci so v zelo kratkem času razvili lastno tehnologijo, ki omogoča distribuirano računanje molekulskega sidranja. Tehnologija je osnovana na programčku, ki omogoča   povezavo uporabnikovega računalnika s strežnikom, ki distribuira del knjižnice molekul pripravljenih za molekulsko sidranje (trenutno 7 000 000 spojin). Po končanem sidranju (s programom RxDock), programček pošlje  izračunane podatke nazaj na zbirno mesto na strežniku. Po analizi sidranih spojin bi bil končni rezultat seznam molekul s potencialno vezavo na terapevtsko tarčo (v našem primeru so to virusni proteini). Nato bi lahko preverili ali so te spojine dobavljive in organizirali biološko testiranje v sodelovanju z ostalimi raziskovalnimi skupinami. Podatke o nedobavljivih spojinah bi v nasprotnem primeru lahko posredovali raziskovalnim skupinam za izvedbo sinteze. V optimalnem scenariju bi lahko identificirali spojine zanimive za farmacevtsko industrijo. V kratkem gre za zgodnje raziskave, ki lahko pripomorejo k razvoju zdravila. Spletna povezava do projekta na https://covid.si/

Skip to content